La Iglesia cordobesa admitió en el siglo XVI que construir una catedral sobre la Mezquita "no fue una buena idea"
En 1590, el mismísimo vicario general de la diócesis de Córdoba, José de Alderete, informó al Papa Sixto V del estado de las obras del templo, y de los riesgos de destrucción del más bello templo...